雖然各種性質的原料加工都會產生垃圾，加工后的原料也都需要經過洗滌才可用于切配，但不同性質的原料，若互相混雜，不僅妨礙加工效率，而且被污染后的原料，洗除異味也相當困難。即使洗凈的加工原料，不嚴格分類擺放，也會產生污染。因此，對不同性質原料的加工用具、作業場所必須進行固定分工，才可能保證加工原料質量。同在加工廚房加工的原料，要特別注意水產宰殺給時鮮果蔬菜帶來的腥昧污染，更要防止禽畜宰殺的羽毛給其他原料造成污染。有些干貨（如牛筋、魚皮漲發過程中）會產生令人特別難以接受的腥臭氣味，比如，操作人員正在忙碌的手或漲發用水觸及或污染其他原料，將會烹調或出品留下隱患。